学院现设农业水利工程系、水文与水资源工程系、水利水电工程系、土木工程系、动力与电气工程系、材料与结构工程系;有农业水利工程、水文与水资源工程、水利水电工程、土木工程、热能与动力工程、电气及其自动化、城市规划、农业建筑与环境工程等8个本科专业; 农业水土工程、水利水电工程、水文与水资源、水力学与河流动力学、水工结构工程、结构工程、岩土工程、土木工程8个硕士学位授权点;农业水土工程、水文与水资源、水利水电工程、农业水资源与水环境工程、水利工程5个博士学位授权点,设有农业工程、水利工程2个博士后流动站。农业水利工程是国家和陕西省重点学科,水利水电工程是陕西省重点学科。农业水利工程专业是国家特色专业点、水文与水资源工程和水利水电工程专业是省级特色建设专业点,农业水利工程专业和水文与水资源工程专业是陕西省名牌专业。
学院拥有旱区农业水土工程教育部重点实验室、农业部旱区农业节水工程重点开放实验室、水工程安全与病害防治研究中心、西北水利科学研究所实验中心、陕西省水利工程质量检测中心站、西北水利水电工程建设监理中心、西北水利水电建筑勘察设计院、咸阳西北水利工程咨询有限公司、陕西省节水灌溉试验中心、测量测绘实验教学中心、电工电子实验教学中心等11个校级科技创新研究及社会服务平台,4个校内实践教学基地、19个校外实践教学基地,农业水工程实验教学示范中心2009年获批国家级实验教学示范中心;主办《水资源与水工程学报》、《水利与建筑工程学报》学术刊物,是陕西省水利学会、水力发电学会的理事单位。