药用植物的生产中存在的问题：中药现代化的源头在药材种植，所以发展药材种植业前景广阔，但目前生产中也存在着亟待解决的问题，主要表现在：第一，全国药材生产区域化还未形成。虽然全国已有600个药材生产基地，但药材生产的区域化问题还未解决，盲目乱引种的现象较为严重，农民在种植时，对其区域性、土质要求等基本不考虑，致使药材产量低、质量差，有的不能药用。
第二，种植零星，不成规模。多数药材产于老、少、穷地区，生产零星分散，经营规模以家庭小生产占主导地位。据统计，国营药材种植场和集体种植场面积占种药面积的10.1%，药材专业户种植面积占8.9%，农民零星种植面积占81%。这种局面很大程度上限制了良种和优质高产技术的推广，也不利于产销沟通。
第三，市场预测能力差，产销价格大起大落。药材生产周期一年的很少，大部分为几年，甚至十几年或更长，所以其生产对市场的反馈就较为迟缓，这就需要有较强的市场预测能力，而一般农户很难做到这一点。所以，就出现“跟着跑”的现象，说种什么，一窝疯都种什么，造成市场饱和，药材积压卖不出去，经济受到损失。
第四，产量第一，不讲质量。由于传统的药材质量标准只限于外观质量，而对于反映其药效的内在质量——有效成分含量无法考查。所以，药材的生产往往是片面追求产量，有的大量施用化肥和农药，不仅能影响药材的原有效药，而且还造成重金属和农药残毒过量，降低了药材的质量。
第五，生产技术落后，经济效益低下。与一般农作物相比，许多药用植物的种植技术较强和特殊，一般农民较难掌握。而目前传统的药材栽培技术较大田农业技术落后、粗放，从事种植的农民文化程度也较低，这些都会影响药材生产的发展和经济效益。
当前，我国正在进行的“中药现代化科技产业行动计划”为解决以上问题提供了很好的机遇。国家首先加强了中药材生产的综合研究，重点抓“中药材生产质量管理规范”（简称GAP），推动药材生产逐步产业化、区域化，建立名优道地药材的生产基地，实施中药材名牌战略。其次加强信息指导，建立中药材信息网，及时发布产、供、销信息，并提供咨询服务，指导药农科学种药，提高经济效益。此外，在“优质种质资源与品种标准化”、“优质高产高效与栽培组合措施最优化”、“采收加工科学合理化”、“绿色优质药材与生产流通无公害化”等方面正在组织人力、物力进行研究、示范，取得经验和成果立即推广。
总之，在新的世纪中，药材生产的科技水平会不断提高，她将为我国国民经济的发展、人民的健康和中医药事业的振兴作出更大的贡献。