省级每年根据当年扶持政策和预算资金安排情况，向设区市、直管县农业合作组织主管部门(财政、农业或农工部)下达申报通知，明确申报条件、扶持内容、每县申报个数等内容。符合申报条件的农民专业合作组织，在申报通知下达后可向县级主管部门提出申请，县级主管部门对材料的合规性、真实性进行审查，按照公开、公平、公正的原则确定县级上报合作社名单。
农业合作社申报补贴条件：符合《中华人民共和国农民专业合作社法》设立条件，依法登记注册2年以上;按照《农民专业合作社会计制度(试行)》(财会〔2007〕15号)的规定进行会计核算，具有比较规范的财务管理制度;具有一定的服务能力，能有效地为成员提供农业专业合作服务，成员原则上不应少于100户。
三、申请补贴政策的三大要点
怎样组织项目申请材料
对项目通知进行剖析，分析其特点和适用范围，根据项目特点合理制订申报排期，编制申报材料。
项目材料要突出：辐射带动能力强，促进周边群众增收作用显著;无污染，对生态环境无不良影响，甚至对环境有益;项目的实施符合当地主导产业发展方向或能引导地方农业发展。
怎么成功申请项目
及时获取项目申报通知：多浏览九大部委及省、市相关网站，及时获取项目申报通知，这是项目申报成功的关键之一。
筛选适宜项目：项目很多也很好，但是不一定合适你，要筛选适宜的项目申报。
项目申请报告编写：项目申请报告要结合自己实际，切实可行是项目申报成功的关键。
按时呈报相关部门：农业部门很多、项目部门也很多，必须按照项目通知要求，准时呈报给对口的部门。
及时沟通和规范运作：现在项目都是待主管部门进行审核、验收并批准后，才能获得相应的扶持、奖励资金。因此，及时沟通、规范运作必不可少。
怎样通过最后项目验收
项目验收很关键，为防止项目资金投入到其他地方乱用，现在项目多采取先建后补模式，因此项目验收直接关系到最终的扶持资金能否到账的问题。
要规范运作，项目资金要用到项目上，不能乱用。
提前准备，包括项目答辩材料、现场建设、财务报表等要准备妥当。
勤沟通，多跑腿。多和地方政府沟通，多和专家沟通，让他们帮助支招儿，把项目做好。
关注项目实施验收信息。项目实施标准及验收信息会在政府网站上发布，或由省市县下发到合作社，合作社要及时掌握验收考察信息，给自己争取准备时间。