最主要区别：农户与非农户是计划经济下的产物（商品粮的因素），在现代社会主义市场经济条件，最主要的区别是非农户口不再享有土地分配权和使用权。
农业户口优势
第一，农业户口最大的优势在于有宅基地和土地，若赶上拆迁的话，会有高额补偿款。
第二，有些地方农村户口的人，凡男的45岁以上、女的40岁以上，都买了养老保险，保费政府出1/3，村里出1/3，自己出1/3。因此，只要出很少一部分钱，男的到60岁，女的到55岁，每月就最低可以领到一定的养老金。相反，非农业户口的人如果没有工作，就必须自己买养老保险。
第三，有些地方医疗保险村里全包，不用出一分钱。如果生病住院，无论大人还是孩子，每年可报销一定的住院费。
第四，有些地方垃圾费、治安费等费用也不用自己出，全由村里出，在这一点上，比非农业户口有优势。
第五，有些地方农村义务教育全部免费。
第六，有些地方规定农村户口如果第一胎是女孩，可生第二胎，不罚款。
第七，有些地方现在村里凡有户口的，不论大小，每人每年能分红，但如果户口迁出，就不能参加分红了。
非农业户口优势
一、招工、失业待遇好。
1、招工：农民要想致富，企业上班是出路。可是企业在招工时原则上只考虑非农业户口，即使没有户口限制，也在主观上优先考虑非农业户口。
2、失业保险：非农业职工失业后，其享受失业保险金标准为本市最低工资标准的70%至90%，最长不超过2年；而农民工与企业终止或解除劳动关系时，其领取失业保险金的标准为本市职工最低工资的40%，根据单位为其连续缴费的时间，一次性支付本人，缴费每满1年发给1个月生活补助，最长不超过1年。
二、同样当兵待遇好。
1、参军：非农业户口的优待金比农业户口的多一倍，城镇户口入伍的义务兵每年1万元，农村户口入伍的义务兵每年5000元，当兵两年就相差1万元。
2、退役：非农业退役士兵和转业士官政府给安置工作，有些地方规定任何单位不得拒绝承担安置任务，政府安置工作后，还可以去劳动和社会保障局参加一次免费的职业技能培训。
3、退役后自谋职业：非农业退役士兵和转业士官自谋职业的，发放一次性安置补助费。退役士兵每人补助35000元，转业士官每人补助55000元；农业户口的退役士兵自谋职业的，发放一次性安置补助费每人1万元。
三、养老保险、医疗保险待遇高。
1、养老