农产品交易中心冷链物流基础设施建设涉及的税种包括：
1. 增值税：农产品交易中心对于购买的冷链物流基础设施和相关服务需要缴纳增值税。具体的税率取决于物品种类和规模。
2. 所得税：农产品交易中心因物流服务而获得的收入需要缴纳所得税。根据中国税法的规定，企业应当依据其实际收入和相关成本计算所得税。
3. 资产税：农产品交易中心在拥有冷链物流基础设施方面需要缴纳资产税。具体的资产税税率根据不同地点和规模而有所不同。
4. 土地使用税：如果农产品交易中心用于建设冷链物流基础设施的土地是属于国有土地，则需根据相关法规缴纳土地使用税。
5. 城市维护建设税和教育费附加：在缴纳增值税和营业税时，还需要缴纳城市维护建设税和教育费附加。
以上税种的具体税率和缴纳方式，需要根据当地政策和法规进行具体查询和确认。