有机水稻种植过程中，种子处理、苗床处理、秧田管理、病虫草害防治等方面都必须符合有机生产的要求。具体来说，种植有机水稻要从以下几个方面入手。(一）选优良种，突出“优”字有机水稻的种子，要选择抗逆性好（主要是抗病虫为害）、分蘖力强、偏大穗、富营养、商品性好、优质米，适宜旱育苗、超稀植栽培模式的优良品种，发芽率在95%以上，纯、净度99%以上，不能越区种植，保证霜前5-7天充分成熟，做到早中晚合理搭配，充分发挥种子的“种尽其用，地尽其利”的作用。
播前进行种子处理，确保一次播种保全苗。(二） 抢前抓早，适时早播当气温稳定在5°C时即可播种，1-2积温带，4月初育苗；3-4积温带，4月15日育苗，4月底之前播完种，不育5月苗。育苗采取大棚旱育或钵体育苗，千方百计培育壮秧。当气温稳定在13°C时，开始插秧，采取超稀植的插秧方式，不插6月秧，提高插秧质量，做到边起秧、边插秧，浅插，插直、插匀、插稀，合理密植，发现缺苗断空地方，进行移苗补栽，确保苗全苗齐苗苗壮。
(三） 合理施肥，保证供应。有机水稻只能施入有机肥，最好施饼肥、鸡粪（必须腐熟、发酵）等，绝对不能施化肥，施底肥要质优量足，每亩可施300kg发酵好的鸡粪。施人均匀，不能堆积，以免烧苗。追肥要少量多次，主要追施优质农家细肥，最好追施饼肥。根据地力、长势和底肥多少，合理追肥，主要追好分蘖肥、调节肥、穗肥、粒肥，保证供应水稻生育期对营养元素的需要。
(四） 洁水灌溉，科学用水有机水稻必须采取洁水灌溉，绝不能用生活污水、工业用水灌田，应做到单排单灌。在水层管理上，以浅为主，以水增温，以水促控，以气养根，以根保叶，活秆成熟。具体灌水方法：移栽期花达水，返青后2-3cm水层，有效分蘖前以浅为主，提高地、水温，促进分蘖；有效分蘖结束时，对生长繁茂地块，立即排水晒田7-10天，控制无效分蘖，晒田程度达到田面发白，地面有裂纹，池面见白根，叶色褪淡挺直，促进根系发育。
排水晒田后，采取干一湿一干的间歇灌溉，以根保叶，养根保蘖。后期如遇到夜间气温低于17°C，采取深水护胎，水层15cm左右，这是防御障碍型低温冷害的有效措施。黄熟期停水。(五）综合防治，抗灾丰收有机食品水稻不能使用化学农药除草和防治病虫害，进行人工除草，可疏松土壤，增强通透性，地净苗清，促进根系发育，防治病虫害主要采取生物和物理措施，如稻田养鸭等。
搞好预测预报，一旦发生，立即防治。
